Phase 5: :memory-vector (JVector + SQLite + LLM-эмбеддинги), memory-abstraction, compaction, MessageContext

- :memory-api — общий контракт MemoryStore/Prefetcher/Reviewer/Tools/MemorySystem
- :memory-md (KMP, kotlinx-io) — Hermes-style §-файлы, keyword overlap
- :memory-vector (JVM-only) — JVector ANN + SQLite + HttpEmbeddingClient
- :standalone — AGENTIK_MEMORY_BACKEND={md,vector,off}, выбор в Main.kt
- :standalone — compaction рабочего контекста (LiteLlmContextCompactor + reviewPreCompaction)
- :proto — MessageContext (origin: user/system/event) на send и в Message
- :server — backward-compat dual-format для POST /messages
- README — env-vars, vector-бэкенд docs

standalone/build.gradle.kts

@@ -3,10 +3,14 @@
 import org.jetbrains.kotlin.gradle.ExperimentalKotlinGradlePluginApi
 import org.jetbrains.kotlin.gradle.targets.jvm.KotlinJvmTarget
 
+import com.github.jengelman.gradle.plugins.shadow.tasks.ShadowJar
+import org.gradle.api.artifacts.ConfigurationContainer
+
 plugins {
     alias(libs.plugins.kotlin.multiplatform)
     alias(libs.plugins.kotlin.serialization)
     alias(libs.plugins.sqldelight)
+    alias(libs.plugins.shadow)
 }
 
 kotlin {
@@ -41,6 +45,11 @@ kotlin {
             // Парсер и загрузчик скилов (YAML frontmatter + markdown body).
             implementation(project(":skills"))
 
+            // Долговременная память (Hermes-style MD-бэкенд).
+            implementation(project(":memory-api"))
+            implementation(project(":memory-md"))
+            implementation(project(":memory-vector"))
+
             // litert-openai: JVM-реализация
             implementation(libs.litert.openai)
             // litert-google: встроенный LiteRT-LM движок, нужен только на runtime
@@ -93,3 +102,55 @@ sqldelight {
         }
     }
 }
+
+// --- Fatjar (uberjar) ---
+//
+// :standalone — KMP jvm-only бэкенд. Стандартный KMP `jvmJar` содержит только
+// наши классы и требует подтянуть все зависимости на runtime через classpath.
+// Для дистрибутива нужен self-contained `*-all.jar`, который содержит и наш
+// код, и runtime classpath. Делается это Shadow-плагином:
+//
+//   1. shadowJar расширяет `jvmJar` (через from(tasks.named("jvmJar")))
+//   2. Добавляет все артефакты из jvmRuntimeClasspath как `zipTree`
+//   3. Корректно сливает META-INF/services (через ServiceFileTransformer)
+//   4. Прописывает Main-Class в манифесте
+//
+// Результат: `build/libs/standalone-*-all.jar` запускается как
+//   java -jar standalone-0.1.0-all.jar
+//
+// KMP-сборка под ios/lin/macos не затрагивается — задача живёт только в jvm.
+// Shadow 8.x не авторегистрирует shadowJar в KMP-проектах (нет стандартного `jar`),
+// поэтому регистрируем явно через tasks.register.
+//
+// В Gradle 9 KGP подменяет `configurations` на сгенерированный dependency-accessor
+// (он возвращает List), поэтому используем прямой доступ к Project API.
+val shadowJarTask = tasks.register<ShadowJar>("shadowJar") {
+    archiveBaseName.set("standalone")
+    archiveClassifier.set("all")
+    description = "Self-contained fatjar with all runtime dependencies bundled."
+    group = "build"
+
+    from(tasks.named("jvmJar"))
+    // javaClass-каст через Any? чтобы вытащить реальный ConfigurationContainer
+    // из любого типа, который сейчас прикидывается `configurations`.
+    val cc = try {
+        @Suppress("UNCHECKED_CAST")
+        configurations as org.gradle.api.artifacts.ConfigurationContainer
+    } catch (_: ClassCastException) {
+        // KGP-generated dependency accessor; обходим через raw project.
+        @Suppress("UNCHECKED_CAST")
+        (project as org.gradle.api.Project).configurations as org.gradle.api.artifacts.ConfigurationContainer
+    }
+    from(cc.getByName("jvmRuntimeClasspath"))
+
+    mergeServiceFiles()
+    duplicatesStrategy = DuplicatesStrategy.EXCLUDE
+
+    manifest {
+        attributes["Main-Class"] = "pw.binom.agentik.standalone.MainKt"
+        attributes["Implementation-Title"] = "agentik-standalone"
+        attributes["Implementation-Version"] = project.version.toString()
+    }
+
+    includeEmptyDirs = false
+}